MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 plasmid plasmIII

Total Repeats: 527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017555	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076360
2	NC_017555	ACA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076360
3	NC_017555	CGA	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
4	NC_017555	GGC	2	6	146	151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
5	NC_017555	GAC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076360
6	NC_017555	GCT	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
7	NC_017555	GC	5	10	308	317	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
8	NC_017555	CGGC	2	8	361	368	0 %	0 %	50 %	50 %	386076360
9	NC_017555	GTC	2	6	396	401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076360
10	NC_017555	GATC	2	8	431	438	25 %	25 %	25 %	25 %	386076360
11	NC_017555	CGG	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076360
12	NC_017555	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076360
13	NC_017555	GAT	2	6	829	834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
14	NC_017555	TGG	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
15	NC_017555	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
16	NC_017555	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
17	NC_017555	GAT	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076361
18	NC_017555	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076361
19	NC_017555	GCG	2	6	1056	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076361
20	NC_017555	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
21	NC_017555	GAC	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
22	NC_017555	GAA	2	6	1236	1241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
23	NC_017555	ATTC	2	8	1317	1324	25 %	50 %	0 %	25 %	386076361
24	NC_017555	CA	3	6	1379	1384	50 %	0 %	0 %	50 %	386076361
25	NC_017555	TTC	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076361
26	NC_017555	GAA	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
27	NC_017555	AAC	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
28	NC_017555	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
29	NC_017555	CAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076361
30	NC_017555	GGT	2	6	1579	1584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
31	NC_017555	GC	3	6	1679	1684	0 %	0 %	50 %	50 %	386076361
32	NC_017555	GGT	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076361
33	NC_017555	AAG	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076361
34	NC_017555	GTC	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076361
35	NC_017555	CGA	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076361
36	NC_017555	AGCC	2	8	1812	1819	25 %	0 %	25 %	50 %	386076361
37	NC_017555	TCC	2	6	2327	2332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076362
38	NC_017555	CTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076362
39	NC_017555	AGC	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
40	NC_017555	ACGTG	2	10	2382	2391	20 %	20 %	40 %	20 %	386076362
41	NC_017555	AGC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
42	NC_017555	TTG	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076362
43	NC_017555	TCG	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
44	NC_017555	CGAA	2	8	2727	2734	50 %	0 %	25 %	25 %	386076362
45	NC_017555	TTTTC	2	10	2761	2770	0 %	80 %	0 %	20 %	386076362
46	NC_017555	CAG	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076362
47	NC_017555	CT	3	6	2849	2854	0 %	50 %	0 %	50 %	386076362
48	NC_017555	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076362
49	NC_017555	GGTC	2	8	2867	2874	0 %	25 %	50 %	25 %	386076362
50	NC_017555	A	6	6	3193	3198	100 %	0 %	0 %	0 %	386076363
51	NC_017555	GCT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076363
52	NC_017555	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076363
53	NC_017555	C	6	6	3321	3326	0 %	0 %	0 %	100 %	386076363
54	NC_017555	ACGT	2	8	3377	3384	25 %	25 %	25 %	25 %	386076363
55	NC_017555	CCTA	2	8	3464	3471	25 %	25 %	0 %	50 %	386076363
56	NC_017555	CG	5	10	3579	3588	0 %	0 %	50 %	50 %	386076363
57	NC_017555	G	6	6	3710	3715	0 %	0 %	100 %	0 %	386076363
58	NC_017555	GGC	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
59	NC_017555	A	6	6	4046	4051	100 %	0 %	0 %	0 %	386076364
60	NC_017555	GCCG	2	8	4081	4088	0 %	0 %	50 %	50 %	386076364
61	NC_017555	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
62	NC_017555	GAA	2	6	4136	4141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
63	NC_017555	ATG	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076364
64	NC_017555	GACC	2	8	4186	4193	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
65	NC_017555	C	6	6	4204	4209	0 %	0 %	0 %	100 %	386076364
66	NC_017555	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076364
67	NC_017555	GTC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
68	NC_017555	TCG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
69	NC_017555	TCG	2	6	4534	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
70	NC_017555	GCT	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076364
71	NC_017555	CAAG	2	8	4666	4673	50 %	0 %	25 %	25 %	386076364
72	NC_017555	GCG	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076364
73	NC_017555	CAG	2	6	4703	4708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076364
74	NC_017555	ACCG	2	8	4715	4722	25 %	0 %	25 %	50 %	386076364
75	NC_017555	GCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076365
76	NC_017555	GC	3	6	4880	4885	0 %	0 %	50 %	50 %	386076365
77	NC_017555	GCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
78	NC_017555	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
79	NC_017555	GCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
80	NC_017555	TGG	2	6	5054	5059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076365
81	NC_017555	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
82	NC_017555	CGT	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
83	NC_017555	CGG	3	9	5124	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
84	NC_017555	CGCTT	2	10	5147	5156	0 %	40 %	20 %	40 %	386076365
85	NC_017555	GCG	2	6	5183	5188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
86	NC_017555	GCG	2	6	5258	5263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
87	NC_017555	GCT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
88	NC_017555	GCC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
89	NC_017555	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076365
90	NC_017555	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076365
91	NC_017555	GCT	2	6	5566	5571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076365
92	NC_017555	GCC	3	9	5611	5619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076365
93	NC_017555	GCCT	2	8	5677	5684	0 %	25 %	25 %	50 %	386076365
94	NC_017555	GAT	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076365
95	NC_017555	CG	3	6	5962	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
96	NC_017555	CGA	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
97	NC_017555	CGGC	2	8	6055	6062	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
98	NC_017555	GC	3	6	6061	6066	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
99	NC_017555	TGCGC	2	10	6097	6106	0 %	20 %	40 %	40 %	386076366
100	NC_017555	TG	3	6	6124	6129	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
101	NC_017555	CGCT	2	8	6149	6156	0 %	25 %	25 %	50 %	386076366
102	NC_017555	TTGG	2	8	6164	6171	0 %	50 %	50 %	0 %	386076366
103	NC_017555	ACG	2	6	6233	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
104	NC_017555	CGGC	2	8	6243	6250	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
105	NC_017555	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076366
106	NC_017555	CG	4	8	6315	6322	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
107	NC_017555	CG	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	386076366
108	NC_017555	TGC	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076366
109	NC_017555	GACG	2	8	6433	6440	25 %	0 %	50 %	25 %	386076366
110	NC_017555	CGA	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076366
111	NC_017555	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
112	NC_017555	CTTGC	2	10	6632	6641	0 %	40 %	20 %	40 %	386076367
113	NC_017555	CGA	2	6	6652	6657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
114	NC_017555	GAAG	2	8	6667	6674	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
115	NC_017555	GC	3	6	6676	6681	0 %	0 %	50 %	50 %	386076367
116	NC_017555	GCGG	2	8	6763	6770	0 %	0 %	75 %	25 %	386076367
117	NC_017555	GAT	2	6	6773	6778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076367
118	NC_017555	GTGAA	2	10	6810	6819	40 %	20 %	40 %	0 %	386076367
119	NC_017555	GA	3	6	6823	6828	50 %	0 %	50 %	0 %	386076367
120	NC_017555	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076367
121	NC_017555	TGC	2	6	6915	6920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076367
122	NC_017555	TGCG	2	8	6933	6940	0 %	25 %	50 %	25 %	386076367
123	NC_017555	AGC	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076367
124	NC_017555	AGC	3	9	7343	7351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
125	NC_017555	GAAA	2	8	7396	7403	75 %	0 %	25 %	0 %	386076368
126	NC_017555	CGC	2	6	7461	7466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076368
127	NC_017555	CAA	2	6	7474	7479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
128	NC_017555	CGG	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
129	NC_017555	ACA	2	6	7514	7519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076368
130	NC_017555	GT	3	6	7524	7529	0 %	50 %	50 %	0 %	386076368
131	NC_017555	CGG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076368
132	NC_017555	GCA	2	6	7587	7592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076368
133	NC_017555	AGT	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076368
134	NC_017555	GC	3	6	7661	7666	0 %	0 %	50 %	50 %	386076368
135	NC_017555	TTTG	2	8	7667	7674	0 %	75 %	25 %	0 %	386076368
136	NC_017555	TCA	2	6	7679	7684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076368
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138	NC_017555	GCA	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076369
139	NC_017555	TTC	2	6	7785	7790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
140	NC_017555	TGAA	2	8	7844	7851	50 %	25 %	25 %	0 %	386076369
141	NC_017555	TCT	2	6	7910	7915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076369
142	NC_017555	TGC	2	6	7936	7941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076369
143	NC_017555	CG	3	6	7970	7975	0 %	0 %	50 %	50 %	386076369
144	NC_017555	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076370
145	NC_017555	CCG	2	6	8164	8169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076370
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147	NC_017555	GGCC	2	8	8240	8247	0 %	0 %	50 %	50 %	386076370
148	NC_017555	GAA	2	6	8252	8257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076370
149	NC_017555	ATTTC	2	10	8266	8275	20 %	60 %	0 %	20 %	386076370
150	NC_017555	AGC	2	6	8456	8461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
151	NC_017555	CTG	2	6	8474	8479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076371
152	NC_017555	CGC	3	9	8489	8497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386076371
153	NC_017555	AGC	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076371
154	NC_017555	TTG	2	6	8542	8547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076371
155	NC_017555	CAA	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
156	NC_017555	GAG	2	6	8602	8607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076371
157	NC_017555	GT	3	6	8632	8637	0 %	50 %	50 %	0 %	386076371
158	NC_017555	GCCTC	2	10	8703	8712	0 %	20 %	20 %	60 %	386076371
159	NC_017555	ACA	2	6	8772	8777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076371
160	NC_017555	CGAC	2	8	8922	8929	25 %	0 %	25 %	50 %	386076372
161	NC_017555	AGC	2	6	9011	9016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076372
162	NC_017555	TCG	2	6	9047	9052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076372
163	NC_017555	AGT	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076372
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167	NC_017555	AGCA	2	8	9448	9455	50 %	0 %	25 %	25 %	386076373
168	NC_017555	GC	3	6	9476	9481	0 %	0 %	50 %	50 %	386076373
169	NC_017555	GTA	2	6	9490	9495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076373
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176	NC_017555	GCAGG	2	10	9703	9712	20 %	0 %	60 %	20 %	386076373
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180	NC_017555	TTCGC	2	10	9775	9784	0 %	40 %	20 %	40 %	386076374
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255	NC_017555	AAG	2	6	13240	13245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076375
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259	NC_017555	TGG	2	6	13583	13588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076376
260	NC_017555	GC	3	6	13592	13597	0 %	0 %	50 %	50 %	386076376
261	NC_017555	ACG	2	6	13615	13620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076376
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263	NC_017555	CGG	2	6	13658	13663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076376
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389	NC_017555	GC	3	6	19056	19061	0 %	0 %	50 %	50 %	386076383
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391	NC_017555	CTG	2	6	19212	19217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076383
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